本中心成立於民國88年8月，成立宗旨在於致力提昇本校對環境微量毒物如戴奧辛、多氯聯苯、重金屬、有機氯化物、鄰苯二甲酸酯及其代謝物、壬基酚、雙酚A、多溴二苯醚、多溴聯苯、高氯酸鹽等甲狀腺干擾物質、有機錫、農藥、短鏈氯化石蠟、有機磷阻燃劑等之分析技術與能力，進而整合臨床醫學、流行病學、生物統計、職業衛生、毒物學及健康風險評估等學門，研究環境微量毒物對人體健康與生態環境之影響。並以此為基礎，發展環境醫學相關之學術研究活動，成為亞洲環境微量毒性物質研究中心，以提高台灣環境微量毒物分析技術及人體健康影響研究領域之學術地位。